孙峪教授团队揭示微生物与我国哮喘/鼻炎发病的城乡差异规律

发布者:生命科学学院发布时间:2021-07-12浏览次数:10

    近日,我校生命科学学院、岭南现代农业科学与技术广东省实验室、广东省农业生物蛋白质功能与调控重点实验室孙峪、邓诣群教授与复旦大学公共卫生学院赵卓慧教授合作,在国际著名学术期刊Microbiome(影响因子:14.7)在线发表了题为“Indoor bacterial, fungal and viral species and functional genes in urban and rural schools in Shanxi Province, China–association with asthma, rhinitis and rhinoconjunctivitis in high school students”的研究论文(论文地址:https://doi.org/10.1186/s40168-021-01091-0)。中山大学公共卫生学院付曦博士和我校生命科学学院研究生区哲远为文章并列第一作者。

  长久以来,发达国家中城市地区的哮喘、鼻炎等慢性呼吸道疾病患病率一直高于乡村地区。多种因素可以引起这一差异,其中微生物被认为是一个重要的潜在因素。过去十年间,在一些发展中国家如中国也经历了快速的城市化发展和环境变化,但尚未有研究关注这些国家生活环境中微生物暴露和城市-乡村健康效应之间的关系。

  本研究对城市和乡村高中教室室内环境中收集的灰尘进行了第一次无扩增宏基因组测序。研究使用多种降维方法、利用线性判别分析寻找宏基因组样本中生物标记物, 精确地解析了微生物种群分类,深度分析了环境中微生物的功能通路,揭示了潜在的健康影响。与农村地区相比,中国山西城市地区哮喘和鼻炎症状的患病率明显更高。这两个区域的微生物组成也有显著差异,几种潜在的保护性和风险微生物与这些症状相关。丁酸盐和丙酸盐代谢相关的基因和通路在农村学校中显著升高,其代谢产物可能为鼻炎、哮喘等炎症提供了保护作用。该研究与以前人类肠道微生物的研论一致,支持微生物代谢的短链脂肪酸对慢性炎症类疾病的保护和预防作用。这项研究扩展了我们对室内微生物组和呼吸系统健康的理解,从功能的角度为室内微生物暴露及健康效应提供了新的见解。

  该研究得到了NSFC-广东联合基金(U1901207)、广东省自然科学基金(2020A1515010845 )(2021A1515010492)、广东省教育部基金(2018KTSCX021)国家自然科学基金(81861138005)的支持。(文图/生命科学学院区哲远)